Karya tulis ilmiah pada program studi PPDGS Prostodonsia FKG USU terdiri atas pembuatan makalah yang berbentuk laporan kasus (case report) dan literatur review yang dipresentasikan pada pertemuan ilmiah prostodontik tingkat nasional atau internasional, serta karya tulis ilmiah akhir berupa publikasi tesis pada jurnal nasional terakreditasi atau internasional.
Panduan pembimbingan karya tulis ilmiah untuk pembuatan tesis tersedia dalam buku penuntun pembuatan tesis, yang didalamnya terdapat persetujuan judul, pembuatan kerangka konsep tulisan, penulisan isi, seminar, dan penyempurnaan karya tulis. Semua prosedur ini didiskusikan dan disetujui oleh pembimbing dan khusus untuk seminar dimintakan masukan dari peserta seminar untuk penyempurnaannya. Prosedur tersebut di atas telah dilaksanakan secara konsisten dan efektif.